Sesiune de calificări palpitantă la Mugello, acolo unde ploaia a ocolit zona și a permis desfășurarea competiției în cele mai bune condiții. De asfaltul uscat a profitat din plin Dani Pedrosa, liderul clasamentului general, cel care a stabilit timpul reper din Q2. Micuțul pilot spaniol de la Repsol Honda a obținut pole-ul stabilind în același timp cel mai bun rezultat de calificare din istoria circuitului, adică 1:47:157. Jorge Lorenzo, de la Yamaha Racing, va pleca de pe poziția secundă a primei linii din grila de start după ce a obținut un timp cu 0,069 mai slab decât al liderului. Poziția a treia a fost ocupată, în mod surprinzător, de către Andrea Dovizioso, pilot de uzină Ducati, cel care a dovedit lumii că prestația lui Valentino Rossi în șaua Ducati în ultimele două sezoane nu s-a datorat neapărat motocicletei, ci poate și abilităților "Doctorului".